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應用數學專業始創于1957年，1979年恢復數學系后重建，1983年獲得碩士學位授予權，1998年獲得博士學位授予權，是全國最早開展應用數學教學和科研的專業之一，也是教育部“長江學者”設崗單位和陜西省名牌專業。
應用數學系有國家教學名師一位、長江特聘教授一位、長江講座教授一位；全職教師共22位，其中教授6位人（博士生導師3位），副教授8位。全系目前開展的研究方向，在應用數學的基礎領域主要有：控制論、動力系統、偏微分方程等；在相關的應用領域主要有：生物數學、流行病動力學、流體力學、數值模擬等。目前承擔的科研項目有：“十五”重大傳染病攻關項目、國家自然科學基金重點項目、國家自然科學基金項目和教學改革項目等。應用數學系與國內外知名院校、研究機構有著廣泛的交流合作，多次主辦國際和國內學術會議，和美國Cornell大學、Iowa大學、Alabama大學、加拿大York大學、意大利Napoli大學等有長期的科研合作協議。
應用數學專業培養具有堅實寬廣的數學基礎、熟練的計算機應用能力、良好的數學建模水平和善于解決科學、工程、金融和管理等領域的實際問題的理科應用型人才。
應用數學本科階段設置的主要課程有：數學分析、高等代數、實變函數、泛函分析、常微分方程、偏微分方程、概率論與數理統計等數學類課程；計算機語言、數據結構、數值分析、數據庫等計算機類課程；數學建模、運籌優化、生物數學、保險統計等應用類課程。培養學生運用數學理論和方法在計算機的幫助下定性、定量地分析和解決問題的能力，讓學生學習、體會、理解數學在當代高科技中應用的思想、原理和方法。該專業為全日制本科，學制為四年。學生修完規定課程及學分，可獲得理學學士學位。畢業生可以從事科研、教學、軟件開發、管理等工作，也可以繼續攻讀數學以及與數學相關的高新技術學科、新興交叉學科的碩士、博士學位。
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