臨床獸醫學為二級學科，由獸醫內科與診斷學、獸醫外產科學、中獸醫學3個三級學科和獸醫院組成，為臨床獸醫學博士學位與碩士學位授予點?，F為南京農業大學校級重點學科。
　　
　　主要研究方向：獸醫臨床病理學、小動物疾病學、畜禽營養代謝病、家畜中毒病及其與畜產品安全、動物營養與免疫、畜禽骨骼生物學、實驗外科、動物生殖生物學與生殖疾病控制、中獸醫學與中西醫結合等。
　　
　　現有教授5名，副教授3名，博士生導師5名，碩士生導師7名。多數均有博士學位，有一支年齡結構合理、在國內有較高影響的學術梯隊。本學科近年來主持國家和部省級課題25項，經費數百萬元；獲多項部省級科技進步獎，轉讓科研成果5項；在國內外核心期刊發表論文近300篇，其中SCI收錄20篇；出版學術專著15部，主編教材8部；在“畜禽營養代謝病”、“畜禽骨骼生物學”、“中西獸醫結合”等研究方向具有鮮明特色，其研究成果為國內同行所矚目和公認。先后派出多名教師出國進修，邀請多名國外著名專家來校講學和合作科研。長期舉辦“國際針灸班”，接受國外留學人員。