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中國科學院植物研究所地處美麗的香山腳下，占地74公頃，是我國植物基礎科學的綜合研究中心。其前身為1928年創建的靜生生物調查所和1929年成立的北平研究院植物研究所，1950年合并為中國科學院植物分類研究所，1953年改為中國科學院植物研究所。1950年以來，先后獲得國家自然科學獎一等獎3項，其他國家級、中科院和省部級科研成果獎160余項。
植物研究所以“整合植物生物學”為學科定位，圍繞與植物學發展密切相關的國家戰略需求——生態環境、現代農業、植物資源和系統進化等領域，利用實驗生物學（包括“組學”）、生物信息學等最新技術和手段，通過植物系統本身不同組織層次（分子、亞細胞、細胞、組織、器官、個體、群體和生態系統）以及植物科學與相關學科和技術的交叉融合進行整合研究。主要發展目標是將植物所建成國際一流的植物科學研究機構，引領和推動我國整合植物生物學的發展。
植物所現有7個研究和支撐部門、1個中外聯合實驗室、2個國家重點實驗室、2個院重點實驗室、10個野外臺站，還有1個公共技術服務中心、中國科學院生態系統研究網絡（CERN）生物分中心，中國科學院內蒙古草業研究中心和中國科學院光生物-太陽能轉化研究中心依托植物所。研究和支撐部門包括系統與進化植物學研究中心、植物生態學研究中心、分子與發育生物學研究中心、光合作用研究中心、信號轉導與代謝組學研究中心、北京植物園(含華西亞高山植物園)；中外聯合實驗室為IOB-TLL甜高粱聯合研發實驗室；國家重點實驗室包括系統與進化植物學國家重點實驗室、植被與環境變化國家重點實驗室；院重點實驗室為中國科學院光合作用與環境分子生理學重點實驗室、中國科學院光生物學重點實驗室；野外臺站包括：內蒙古錫林郭勒草原生態系統國家野外科學觀測研究站、內蒙古鄂爾多斯草地生態系統國家野外科學觀測研究站、湖北神農架森林生態系統國家野外科學觀測研究站，中國科學院北京森林生態系統定位研究站，中國科學院植物研究所正藍旗渾善達克防沙治沙生態研究試驗站、中國科學院植物研究所多倫恢復生態學試驗示范研究站、中國科學院植物研究所中國北方林生態系統定位研究站、中國科學院植物研究所內蒙古東烏珠穆沁草原生態系統管理研究站、中國科學院植物研究所古田山森林生物多樣性與氣候變化研究站、中國科學院植物所內蒙古農牧業科學院烏蘭察布草地生態研究站。此外，植物所還擁有亞洲最大的植物標本館，截至2010年底，標本館共收藏標本260余萬份。數字化植物標本館共收錄14家單位的331萬余份標本數據，圖像信息167萬份。2008年開始建設的植物圖像庫目前已收錄圖片總量54.5萬幅。
植物所是中國植物學會、北京生態學會、北京植物生理學會、中國植物學會植物園分會、中國花卉協會蕨類植物分會、Flora of China編輯委員會和Journal of Plant Physiology中國編輯部的掛靠單位。主辦的刊物有：Journal of Integrative Plant Biology、Journal of Systematics and Evolution、Journal of Plant Ecology，《植物生態學報》、《植物學報》、《生物多樣性》、《生命世界》，其中前3個被SCI收錄。
植物所是我國首批博士、碩士學位授予權單位之一，具有植物學、發育生物學、生態學三個二級學科博士研究生培養點，植物學、發育生物學、生態學、細胞生物學四個二級學科碩士研究生培養點，并設有植物學、發育生物學、生態學學科博士后流動站。
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