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本碩士點設在水產學院，授予農學碩士學位。
漁業資源學科是廣東海洋大學和中國水產科學院南海水產研究所結合南海海洋漁業資源的地理條件與南海熱帶、亞熱帶海洋漁業生態環境特點而建立的碩士培養點。本學科有一支穩定高素質的導師隊伍，現有研究員7名，副教授3名，其中有2名教授是博士生導師。在熱帶、亞熱帶漁業資源研究領域處于國內領先水平，下設二個研究方向：（1）漁業資源開發與保護方向。主要研究漁業資源調查與評估的理論與方法，研究漁業資源開發與保護的關鍵技術與應用。（2）漁業生態環境方向。主要研究漁業水域污染防治理論與技術，漁業水域環境檢測與保障技術，漁業水域環境可持續利用理論與技術，漁業環境信息與信息系統應用技術，探索退化漁業生態系統的恢復途徑，遏制水域環境惡化趨勢。
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