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本碩士點設在水產學院，授予農學碩士學位。
水產養殖學科是國家特色專業建設點，廣東省重點學科、名牌專業，于1999年獲碩士學位授予權。本學科以熱帶、亞熱帶海洋水生經濟動物為主要研究對象，已形成了鮮明的熱帶、亞熱帶海洋特色，注重“產學研”緊密結合，著力研究解決生產中的難點和熱點課題，加速科研成果產業化。設有水產經濟動物生物學及種苗工程、水產經濟動物繁殖生物學、水產經濟動物免疫學及病害控制、水產無脊椎動物增養殖及珍珠培育、水產經濟動物營養與飼料、水域生態學等研究方向。有一支穩定高素質的導師隊伍，現有教授13名，副教授10名，其中有博士15名，還有4名教授是博士生導師。本學科點依托廣東水省水產經濟動物病原生物學及流行病學重點實驗室，建有設備較為先進的繁殖生物學、漁業環境保護、營養與病害、水產增養殖學等實驗室。近年來承擔國家自然科學基金、國家“973”計劃、國家“863”計劃、國家支撐計劃、農業部科技成果轉化、教育部及廣東省重點項目多項，研究經費充足。獲得廣東省科學技術一等獎1項、二等獎1項、三等獎3項。
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