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  一、背景情況
 
  我校曾由美籍華人陳樹新教授牽頭于2000年前后建立生物信息中心,由于陳教授在國內時間短暫,具體負責人員生物學知識相對薄弱,與具體科研項目結合不夠,沒有專門的科研項目支撐、人員配備及待遇等因素,雖然參與的人員付出了很多努力,生物信息中心始終沒能正常運轉。經協商籌備,學校于20054月重新任命生命科學學院陶士珩教授擔任我校生物信息學研究中心主任。
 
  二、主要研究方向和研究內容
 
  將重點進行以下幾個方面的研究與服務:
 
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  1.鏡像主要的核酸、蛋白數據庫。如核酸數據庫GenBank、EMBL,蛋白數據庫Swiss-protPir、三維結構數據庫PDBSCOP等;
 
  2.建立與我校研究相關的生物物種核酸、蛋白二級數據庫;
 
  3.建立在線生物信息分析工具,如Blast序列同源搜索、引物設計、大分子結構與功能分析,等等,為我校生物學各相關專業的分子生物學研究提供方便;
 
  4.為我校具體的研究項目提供特化的信息服務。
 
 ?。ǘ┥镄畔⒄戆l掘和研究
 
  1.群體遺傳理論在基因定位中的應用研究,為人類及動物重要遺傳病基因的研究提供新策略;
 
  2.小麥EST和基因組生物信息學分析,為小麥重要農藝性狀相關基因的克隆及小麥基因組的研究提供新的方法,并進行小麥品質及其他優良性狀預測等工作;
 
  3.植物比較基因組研究研究。通過比較基因組研究小麥、玉米等作物重要的農藝性狀相關基因;
 
  4.動物病害數據庫,為動物病害的防治,發生機制的研究提供方便;
 
  5.植物病害數據庫,為植物病害分子機制的研究提供方便;
 
  5.中草藥綜合數據庫及西北植物數據庫,為中草藥標準化栽培、藥效成分的提取等研究提供便利;
 
  6.建立大分子結構模擬和藥物設計生物信息平臺,為醫藥、中藥、動物藥、農藥的開發提供一種新的研究平臺;
 
  7.開發商業化的生物信息學分析軟件。
 
  三、主要研究成果、獲獎和突出進展
 
  生物信息中心成立三年以來,發表SCI研究論文5篇,累計影響因子超過15分。主編十一五規劃生物信息學教材一本(科學出版社)。
 
  四、人才培養和隊伍建設情況
 
  研究中心人員組成充分體現多學科交叉的特點,包含從事計算機軟件設計、分子生物學、計算機模擬技術、群體與數量遺傳學、藥物設計、有機合成、指紋圖譜鑒定等領域的專家、學者和研究生組成。
 
  五、運行管理
 
  西北農林科技大學生物信息研究中心掛靠生命學院,業務上由學校和科研處領導,日常管理由生命學院負責,研究中心的所有人員的行政管理歸屬關系不變。
 
  六、國內外學術交流和在國內外產生的影響
 
  生物信息中心研究生分別參加了由國家自然科學基金主辦的龍星計劃生物信息培訓和2007年生物信息研討會以及2007年全國生物信息學研究生暑期學校,一方面了解了本學科前沿動態,充實了知識,另一方面通過對外的學術交流,擴大了生物信息中心的影響。
 
  邀請美國佛羅里達大學計算生物學教授陳樹新教授,每年定期來我校舉辦講學及其他學術交流活動;期間分別為本科生和研究生舉辦生物信息學講座。陶士珩教授作為訪問學者正在美國亞利桑那大學進化生物學系進行學術交流,擬邀請其聯系導師著名生物信息學與統計遺傳學教授Bruce Walsh博士每2年一次來我校訪問講學。
 
  七、下一步發展設想
 
  我校曾在作物育種、林木育種、蔬菜瓜果育種、動物育種、昆蟲分類、植物病理、生物制藥、胚胎工程、干細胞培養等領域取得了輝煌的成績。然而生物學研究已進入基因組和后基因組時代,生物學研究方法和模式已經發生根本的改變,從分子水平闡明生長、發育、疾病發生、生物環境互作機制,通過基因工程和分子輔助育種加速農業研究已成為大趨勢。必須承認我校在分子生物學研究方面滯后于國際和國內同行。如何迅速提升我校生物學相關學科的研究水平、如何融入基因組合功能基因組研究的大潮、如何利用分子生物學研究技術及基因工程加速傳統的動植物育種已成為我校提升生物學相關領域研究水平的關鍵。我們的初步設想是,緊密結合我校承擔的國家科研項目,首先建立相關生物信息數據庫,如小麥、玉米、苜蓿、楊樹、松樹、人、牛、羊、重要的植物病害、重要的動物病害數據庫,為我校及國內其它研究機構具體研究提供信息服務;其次,如果條件成熟,建立我國西部、秦巴山區天然產物數據及有機化合物服務平臺,為我校中草藥指紋圖譜鑒定、無公害農藥的設計與研究提供服務。
 
  希望學校能定期提供一定數量的中心運行經費,以便讓中心正常運轉,吸引校內外學者和研究生積極參與中心的建設與研究。為提升我校分子生物學、群體遺傳學與分子進化、有機合成及藥物篩選、種質資源分子鑒定與指紋圖譜研究等領域的研究水平做出貢獻。
 
  八、聯系方式
 
  地  址:陜西楊凌西北農林科技大學生物信息學研究中心
 
  郵政編碼:712100
 
  電  話:02987091060
 
  電子郵件:shihengt@nwsuafeducn
 
  
 

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