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2018 年碩士生入學考試專業基礎課大綱 考試科目名稱:基因組信息學與生物統計 考試科目代碼:814 一、 考試要求 掌握常用的生物統計方法,了解基因組信息學中的基本數據類型,能運用所 學的基本理論和實驗技能,說明和解決基因組信息學中相關的問題。 二、 考試內容 (一)《基因組信息學》部分 1)基因組信息學中生物學基礎 a. DNA 的結構、分子生物學中心法則 b. 基因組結構與基因表達調控 2)人類基因組及基因組數據庫 a. 人類基因組計劃及測序策略 b. NCBI 及 Ensembl 數據庫、UCSC 基因組瀏覽器 c. ENCODE 計劃、TCGA 計劃 3)基因組信息分析 a. 真核生物基因組特點 b. 基因組序列分析 c. 基因識別方法 d. 非編碼區域分析與調控元件識別 4)基因芯片數據分析 a. 基因芯片分類與數據表示 b. 基因芯片數據預處理 c. 基因表達差異的顯著性分析 d. 基因表達譜聚類分析 e. 基因表達數據的分類分析 f. 主成分分析 PCA 5)新一代高通量測序數據分析 a. 了解新一代高通量測序技術的基本原理 b. 了解 ChIP-Seq 技術的基本原理及基本分析工具 (Bowtie、MACS) c. 了解 RNA-Seq 技術的基本原理及基本分析工具 (tophat、cufflinks) (二)《生物統計》部分 1)生物統計學的基本知識 a. 生物統計學概念 b. 生物統計學術語 2)實驗資料的整理與統計描述 a. 實驗資料的收集與整理 b. 統計圖表的應用 c. 實驗資料特征數的計算 3) 概率與概率分布 a. 概率基礎知識 b. 幾種常見的理論分布 (正態分布,二項分布,泊松分布) c. 抽樣分布的特征以及中心極限定理 4) 統計推斷 a. 假設檢驗的原理與方法 b. 樣本平均數的假設檢驗 c. 樣本頻率的假設檢驗 d. 參數的區間估計與點估計 e. 方差的同質性檢驗 5) Χ 2 檢驗 a. Χ 2 檢驗的原理與方法 b. 正態分布和二項分布的擬合優度檢驗 c. 計數資料的Χ 2 檢驗 6) 方差分析 a. 方差分析的基本原理 b. 單因素方差分析 c. 二因素方差分析 d. 方差分析的基本假定和數據轉換 7) 簡單直線回歸與相關分析 a. 回歸和相關的概念 b. 直線回歸分析 c. 直線相關 8) 多重線形相關與回歸 a. 多重線性相關與回歸中涉及的統計量的概念和意義 b. 多重回歸分析 c. 多重相關分析 三、 試卷結構 a) 考試時間 180 分鐘,滿分 150 分 b) 基因組信息學與生物統計各占 75 分 c) 題型結構: a: 填空題(30 分) b: 解答題(包括簡答與計算題)(120 分) 四、 參考書目 1. 喬納森.佩夫斯納著,孫之榮譯,《生物信息學與功能基因組學》,化學工 業出版社。 2. 孫嘯、陸祖宏、謝建明,《生物信息學基礎》,清華大學出版社。 3. 李春喜,王志和等,《生物統計學》(第四版),科學出版社。 4. 杜榮騫編,《生物統計學》第三版,高等教育出版社
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