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考試大綱
科目代碼： 851 考試科目： 生物信息學
一、考試形式
本試卷滿分為 150 分，考試時間為 180 分鐘。
二、考查內容
1.生物信息學相關概念、主要研究方向、相關發展簡史、相關重
要事件及發展趨勢。
2.生物信息學中常用生物數據（核酸序列數據、蛋白質序列數據、
蛋白質結構數據）的測定方法，常用的數據庫序列數據存儲格式。
3.重要的生物信息學網站，重要數據庫的使用方法，主要包括核
酸數據庫、基因組數據庫、蛋白質數據庫及蛋白質結構數據庫。生物
信息學數據庫的相關概念。
4.遺傳密碼與蛋白合成概念、方法，開放閱讀框的預測方法，真
核生物基因預測與外顯子識別關系的方法，基因序列的注釋方法。
5.序列比對的概念，掌握一致性、相似性、同源性的概念及其之
間的區別，常用的序列比對算法和軟件，常見打分矩陣和空位罰分體
系。
6.序列數據庫搜索工具 BLAST，各種 BLAST 結果的含義， BLAST
算法的原理及 NCBI BLAST 各參數的含義。
7.系統發育進化樹相關概念，使用 MEGA 等軟件構建進化樹的方
法，三種常見的進化樹構建算法（近鄰法、最大簡約法、最大似然法）
的概念、原理、方法。
8.蛋白質結構的組成和層次，序列相似性與結構相似性同蛋白質
分類之間的關系，蛋白質結構分類及相關數據庫。蛋白質三維結構的
可視化的概念和方法。
9.蛋白質家族、蛋白質信號及其表示方式，主要包括一致序列、
序列模式、多序列聯配無空位片段、序列譜以及相關數據庫，主要包
括 Prosite、PRINTS、Pfam 等數據庫。
10.蛋白質序列分析與功能的預測方法，主要包括理化性質、跨
膜螺旋、信號肽、翻譯后修飾、亞細胞定位等。蛋白質結構預測常用
方法，包括二級結構和三級結構。
11.基因和蛋白質芯片的概念、原理及其主要應用。
12.數據挖掘與機器學習的概念，常見機器學習算法。
13.基于結構的藥物設計的概念、方法。
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