遼寧大學2021年招收攻讀博士學位研究生(普通招考方式)

初試科目考試大綱

科目代碼：3049              

科目名稱：生物信息學

滿分：100分

考查內容

1.生物信息學中常用生物數據（核酸序列、蛋白質序列、蛋白質結構）的測定方法和數據存儲格式。

2.常用的生物信息學網站（NCBI、EBI、ExPASy三大門戶網站）、數據庫的相關概念和使用方法，如核酸數據庫、基因組數據庫、蛋白質數據庫及蛋白質結構數據庫，能夠熟練使用常見生物信息學網站。

3.序列比對的基本概念、算法、常用軟件以及比對方法，常見打分矩陣和空位罰分體系，一致性、相似性、同源性之間的共同點和不同點，能夠熟練使用工具軟件開展序列比對。

4.序列數據庫搜索工具BLAST， BLAST的算法，各種BLAST的方法和原理，能夠熟練使用BLAST工具軟件檢索和分析。

5.系統發育進化樹相關概念、方法，使用MEGA等進化樹分析軟件構建進化樹的方法，三種常見的進化樹（近鄰法、最大簡約法、最大似然法）的構建算法和檢驗方法，能夠熟練使用工具軟件制作微生物系統發育進化樹。

6.蛋白質結構的組成和層次，序列相似性與結構相似性同蛋白質分類之間的關系，蛋白質結構分類及相關數據庫。蛋白質三維結構的可視化的概念、方法。常用蛋白質結構預測方法，包括二級結構和三級結構。能夠熟練使用工具軟件開展蛋白質的各種功能的計算預測，能夠熟練使用工具軟件查看蛋白質的三維結構，能夠根據提供信息開展蛋白質三維結構的同源模建和分子動力學計算模擬。

7.數據挖掘與機器學習的概念，常見機器學習算法，包括決策樹、隨機森林、支持向量機等。

8.基于結構的藥物設計，小分子化合物數據庫文件格式及轉換方法，分子對接、分子動力學模擬的基本概念和方法，能夠熟練使用工具軟件開展虛擬藥物篩選設計。

9.生物大數據的相關概念、意義及其研究進展。