我院發酵工程專業源于1993年設立動物食品科學碩士點，1998年1月獲批食品科學博士點中的食品微生物與食品生物技術研究方向。
　　
　　隨著多年建設，發酵工程專業已建立了學歷層次高、年齡結構合理的師資隊伍，同時著眼于學科建設需要，擇優引進歸國人才，加強在職教師深造，學院現有在職教師28名，其中教授7名，副教授13名，講師4名，在職教師中具有博士學位的7名，在讀博士10名，博士生導師6名，碩士生導師10名。
　　
　　學院現有1個博士點（食品科學）、4個碩士點（食品科學、發酵工程、農產品貯藏與加工工程、糧食、油脂及植物蛋白工程）。
　　
　　發酵工程碩士點現設3個研究方向，微生物酶工程及其應用（新型微生物酶的開發及應用、新型微生物酶基因的克隆與表達、發酵酶技術應用）、微生物代謝與發酵工程（新型資源微生物的分離篩選和鑒定；食品級基因工程菌的構建及其高密培養和發酵優化；特殊生物活性產物的形成機理、結構和功能分析與應用）、生物活性物質分離工程（發酵產物和天然產物中生物活性成分的提取、分離、純化和鑒定技術研究、生物制菌等）。強化教師素質、改善科研條件、提高科研水平、全方位爭取科研項目、注重產學研聯合、實現科技成果轉化、開展社會服務是我院學科建設的重要舉措，10多年來，我院共承擔縱橫向科研項目一百余項，多項成果通過了國家、部省級鑒定，獲部省級科技進步獎7項，獲國家專利5項。我們本著擇優錄取的原則，廣納全國各地優秀研究生生源，招生規模也逐年擴大。歷屆研究生畢業現已成為科研機構、大專院校、企事業單位的專業骨干，用人單位對于學校所賦予他們的專業水平、綜合素質、敬業精神給予了很高評價。本專業熱誠歡迎有志于食品科學研究、具有拼博精神的莘莘學子。